Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fgd1P52734 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms