Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa10P50708 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa10P50708 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa10P50708 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms