Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LmnaP48678 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LmnaP48678 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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