Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx2P48379 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rfx2P48379 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms