Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VdrP48281 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VdrP48281 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms