Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Epb41P48193 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Epb41P48193 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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