Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SrprbP47758 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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