Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
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