Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms