Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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