Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms