Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BgnP28653 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BgnP28653 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BgnP28653 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BgnP28653 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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