Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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