Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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