Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
P20040 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
P20040 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
P20040 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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