Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phka1P18826 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phka1P18826 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms