Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P18525 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P18525 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P18525 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P18525 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P18525 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P18525 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P18525 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
P18525 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
P18525 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
P18525 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18525 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18525 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18525 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18525 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18525 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18525 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18525 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18525 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18525 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms