Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms