Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PcnaP17918 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PcnaP17918 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PcnaP17918 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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