Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pou4f1P17208 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pou4f1P17208 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms