Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf1P09925 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Surf1P09925 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms