Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01647 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01647 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01647 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01647 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01647 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01647 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01647 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01647 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01647 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01647 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01647 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01647 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms