Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hcn1O88704 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hcn1O88704 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hcn1O88704 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hcn1O88704 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hcn1O88704 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Hcn1O88704 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hcn1O88704 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hcn1O88704 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hcn1O88704 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hcn1O88704 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hcn1O88704 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hcn1O88704 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hcn1O88704 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hcn1O88704 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hcn1O88704 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hcn1O88704 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hcn1O88704 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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