Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms