Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms