Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Opn1mwO35599 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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