Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ArxO35085 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ArxO35085 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ArxO35085 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ArxO35085 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ArxO35085 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ArxO35085 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ArxO35085 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ArxO35085 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms