Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms