Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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