Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm3278L7N2D2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3278L7N2D2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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