Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm20877J3QPZ4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20877J3QPZ4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms