Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm8356J3QPD3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm8356J3QPD3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm8356J3QPD3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8356J3QPD3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Gm8356J3QPD3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm8356J3QPD3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8356J3QPD3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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