Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Gm19965J3QNY8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Gm19965J3QNY8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Gm19965J3QNY8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Gm19965J3QNY8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm19965J3QNY8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Gm19965J3QNY8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Gm19965J3QNY8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Gm19965J3QNY8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Gm19965J3QNY8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gm19965J3QNY8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gm19965J3QNY8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gm19965J3QNY8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm19965J3QNY8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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