Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm21060J3KMU4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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