Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20828J3KMI7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms