Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3443F7CCV5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3443F7CCV5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms