Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5861F6VCN9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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