Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pagr1bF6V0H0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms