Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms