Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo5cE9Q1F5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo5cE9Q1F5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms