Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ccdc175E9PVB3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms