Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms