Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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