Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap58B2RW38 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap58B2RW38 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms