Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ankrd34aB2RW11 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms