Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spocd1B1ASB6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms