Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf2A3KGV1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms