Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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PtprfA2A8L5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PtprfA2A8L5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PtprfA2A8L5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprfA2A8L5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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