Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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