Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm4T1NXB5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vstm4T1NXB5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms